Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn3Q9WUK7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn3Q9WUK7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn3Q9WUK7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn3Q9WUK7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn3Q9WUK7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn3Q9WUK7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Opn3Q9WUK7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opn3Q9WUK7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opn3Q9WUK7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opn3Q9WUK7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Opn3Q9WUK7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opn3Q9WUK7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opn3Q9WUK7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opn3Q9WUK7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn3Q9WUK7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn3Q9WUK7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn3Q9WUK7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn3Q9WUK7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn3Q9WUK7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Opn3Q9WUK7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Opn3Q9WUK7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Opn3Q9WUK7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Opn3Q9WUK7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Opn3Q9WUK7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Opn3Q9WUK7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Opn3Q9WUK7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms