Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdh13Q9WTR5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh13Q9WTR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh13Q9WTR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh13Q9WTR5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh13Q9WTR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh13Q9WTR5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh13Q9WTR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh13Q9WTR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh13Q9WTR5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh13Q9WTR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh13Q9WTR5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh13Q9WTR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh13Q9WTR5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh13Q9WTR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh13Q9WTR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh13Q9WTR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh13Q9WTR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh13Q9WTR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh13Q9WTR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh13Q9WTR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh13Q9WTR5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh13Q9WTR5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh13Q9WTR5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh13Q9WTR5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh13Q9WTR5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdh13Q9WTR5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdh13Q9WTR5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdh13Q9WTR5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh13Q9WTR5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh13Q9WTR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh13Q9WTR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh13Q9WTR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh13Q9WTR5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh13Q9WTR5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh13Q9WTR5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh13Q9WTR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh13Q9WTR5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh13Q9WTR5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh13Q9WTR5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh13Q9WTR5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms