Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnf103Q9R1W3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnf103Q9R1W3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf103Q9R1W3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf103Q9R1W3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf103Q9R1W3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf103Q9R1W3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf103Q9R1W3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf103Q9R1W3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf103Q9R1W3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf103Q9R1W3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf103Q9R1W3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf103Q9R1W3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf103Q9R1W3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf103Q9R1W3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf103Q9R1W3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf103Q9R1W3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf103Q9R1W3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rnf103Q9R1W3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf103Q9R1W3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rnf103Q9R1W3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf103Q9R1W3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf103Q9R1W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf103Q9R1W3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf103Q9R1W3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf103Q9R1W3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf103Q9R1W3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf103Q9R1W3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf103Q9R1W3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf103Q9R1W3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rnf103Q9R1W3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf103Q9R1W3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf103Q9R1W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf103Q9R1W3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf103Q9R1W3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf103Q9R1W3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms