Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sept6Q9R1T4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept6Q9R1T4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept6Q9R1T4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept6Q9R1T4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept6Q9R1T4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept6Q9R1T4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept6Q9R1T4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept6Q9R1T4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept6Q9R1T4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept6Q9R1T4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept6Q9R1T4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept6Q9R1T4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept6Q9R1T4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept6Q9R1T4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept6Q9R1T4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept6Q9R1T4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept6Q9R1T4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept6Q9R1T4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept6Q9R1T4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sept6Q9R1T4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sept6Q9R1T4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept6Q9R1T4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sept6Q9R1T4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sept6Q9R1T4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sept6Q9R1T4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sept6Q9R1T4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sept6Q9R1T4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sept6Q9R1T4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sept6Q9R1T4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sept6Q9R1T4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sept6Q9R1T4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms