Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Atp2b2Q9R0K7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Atp2b2Q9R0K7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Atp2b2Q9R0K7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Atp2b2Q9R0K7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Atp2b2Q9R0K7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Atp2b2Q9R0K7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Atp2b2Q9R0K7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Atp2b2Q9R0K7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Atp2b2Q9R0K7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atp2b2Q9R0K7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Atp2b2Q9R0K7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Atp2b2Q9R0K7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Atp2b2Q9R0K7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Atp2b2Q9R0K7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Atp2b2Q9R0K7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Atp2b2Q9R0K7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Atp2b2Q9R0K7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Atp2b2Q9R0K7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Atp2b2Q9R0K7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Atp2b2Q9R0K7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Atp2b2Q9R0K7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Atp2b2Q9R0K7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Atp2b2Q9R0K7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atp2b2Q9R0K7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Atp2b2Q9R0K7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Atp2b2Q9R0K7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Atp2b2Q9R0K7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Atp2b2Q9R0K7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Atp2b2Q9R0K7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Atp2b2Q9R0K7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Atp2b2Q9R0K7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Atp2b2Q9R0K7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Atp2b2Q9R0K7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Atp2b2Q9R0K7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Atp2b2Q9R0K7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Atp2b2Q9R0K7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Atp2b2Q9R0K7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Atp2b2Q9R0K7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Atp2b2Q9R0K7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Atp2b2Q9R0K7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Atp2b2Q9R0K7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Atp2b2Q9R0K7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Atp2b2Q9R0K7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Atp2b2Q9R0K7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Atp2b2Q9R0K7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Atp2b2Q9R0K7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Atp2b2Q9R0K7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Atp2b2Q9R0K7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Atp2b2Q9R0K7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atp2b2Q9R0K7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atp2b2Q9R0K7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Atp2b2Q9R0K7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atp2b2Q9R0K7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atp2b2Q9R0K7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atp2b2Q9R0K7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms