Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ChmlQ9QZD5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ChmlQ9QZD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmlQ9QZD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChmlQ9QZD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChmlQ9QZD5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChmlQ9QZD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChmlQ9QZD5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChmlQ9QZD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChmlQ9QZD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChmlQ9QZD5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChmlQ9QZD5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ChmlQ9QZD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChmlQ9QZD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChmlQ9QZD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChmlQ9QZD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChmlQ9QZD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChmlQ9QZD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChmlQ9QZD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChmlQ9QZD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmlQ9QZD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmlQ9QZD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChmlQ9QZD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ChmlQ9QZD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms