Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndrg3Q9QYF9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndrg3Q9QYF9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndrg3Q9QYF9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndrg3Q9QYF9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndrg3Q9QYF9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndrg3Q9QYF9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndrg3Q9QYF9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndrg3Q9QYF9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndrg3Q9QYF9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndrg3Q9QYF9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndrg3Q9QYF9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndrg3Q9QYF9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndrg3Q9QYF9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndrg3Q9QYF9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndrg3Q9QYF9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndrg3Q9QYF9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndrg3Q9QYF9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndrg3Q9QYF9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms