Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42ep4Q9JM96 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42ep4Q9JM96 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42ep4Q9JM96 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42ep4Q9JM96 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42ep4Q9JM96 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42ep4Q9JM96 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdc42ep4Q9JM96 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdc42ep4Q9JM96 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdc42ep4Q9JM96 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdc42ep4Q9JM96 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdc42ep4Q9JM96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdc42ep4Q9JM96 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42ep4Q9JM96 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42ep4Q9JM96 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42ep4Q9JM96 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42ep4Q9JM96 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc42ep4Q9JM96 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42ep4Q9JM96 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42ep4Q9JM96 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42ep4Q9JM96 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc42ep4Q9JM96 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42ep4Q9JM96 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc42ep4Q9JM96 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42ep4Q9JM96 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42ep4Q9JM96 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42ep4Q9JM96 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42ep4Q9JM96 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42ep4Q9JM96 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc42ep4Q9JM96 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc42ep4Q9JM96 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc42ep4Q9JM96 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms