Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PnkpQ9JLV6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PnkpQ9JLV6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PnkpQ9JLV6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PnkpQ9JLV6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PnkpQ9JLV6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PnkpQ9JLV6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PnkpQ9JLV6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PnkpQ9JLV6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnkpQ9JLV6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnkpQ9JLV6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PnkpQ9JLV6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PnkpQ9JLV6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PnkpQ9JLV6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PnkpQ9JLV6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PnkpQ9JLV6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PnkpQ9JLV6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PnkpQ9JLV6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PnkpQ9JLV6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PnkpQ9JLV6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PnkpQ9JLV6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PnkpQ9JLV6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PnkpQ9JLV6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PnkpQ9JLV6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PnkpQ9JLV6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PnkpQ9JLV6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PnkpQ9JLV6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PnkpQ9JLV6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PnkpQ9JLV6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PnkpQ9JLV6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PnkpQ9JLV6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PnkpQ9JLV6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PnkpQ9JLV6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PnkpQ9JLV6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PnkpQ9JLV6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PnkpQ9JLV6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PnkpQ9JLV6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PnkpQ9JLV6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PnkpQ9JLV6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PnkpQ9JLV6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PnkpQ9JLV6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PnkpQ9JLV6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PnkpQ9JLV6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PnkpQ9JLV6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PnkpQ9JLV6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PnkpQ9JLV6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PnkpQ9JLV6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PnkpQ9JLV6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PnkpQ9JLV6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms