Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrlQ9JJU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bgrlQ9JJU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrlQ9JJU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bgrlQ9JJU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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