Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA7

Ccnl2, Cyclin-L2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl2Q9JJA7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnl2Q9JJA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnl2Q9JJA7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnl2Q9JJA7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnl2Q9JJA7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnl2Q9JJA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl2Q9JJA7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnl2Q9JJA7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnl2Q9JJA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnl2Q9JJA7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnl2Q9JJA7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl2Q9JJA7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnl2Q9JJA7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnl2Q9JJA7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccnl2Q9JJA7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl2Q9JJA7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl2Q9JJA7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccnl2Q9JJA7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl2Q9JJA7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccnl2Q9JJA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccnl2Q9JJA7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl2Q9JJA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl2Q9JJA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl2Q9JJA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms