Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnip1Q9JJ57 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnip1Q9JJ57 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnip1Q9JJ57 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnip1Q9JJ57 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnip1Q9JJ57 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnip1Q9JJ57 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnip1Q9JJ57 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnip1Q9JJ57 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnip1Q9JJ57 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnip1Q9JJ57 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnip1Q9JJ57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnip1Q9JJ57 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnip1Q9JJ57 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnip1Q9JJ57 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnip1Q9JJ57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnip1Q9JJ57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnip1Q9JJ57 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnip1Q9JJ57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnip1Q9JJ57 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnip1Q9JJ57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnip1Q9JJ57 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnip1Q9JJ57 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnip1Q9JJ57 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnip1Q9JJ57 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kcnip1Q9JJ57 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kcnip1Q9JJ57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnip1Q9JJ57 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms