Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smad9Q9JIW5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Smad9Q9JIW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smad9Q9JIW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smad9Q9JIW5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smad9Q9JIW5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smad9Q9JIW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smad9Q9JIW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smad9Q9JIW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smad9Q9JIW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smad9Q9JIW5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smad9Q9JIW5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smad9Q9JIW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smad9Q9JIW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smad9Q9JIW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smad9Q9JIW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smad9Q9JIW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smad9Q9JIW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad9Q9JIW5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smad9Q9JIW5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad9Q9JIW5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad9Q9JIW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad9Q9JIW5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smad9Q9JIW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad9Q9JIW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms