Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cwc15Q9JHS9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cwc15Q9JHS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc15Q9JHS9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cwc15Q9JHS9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cwc15Q9JHS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cwc15Q9JHS9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cwc15Q9JHS9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cwc15Q9JHS9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc15Q9JHS9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cwc15Q9JHS9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc15Q9JHS9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc15Q9JHS9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc15Q9JHS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc15Q9JHS9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc15Q9JHS9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc15Q9JHS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc15Q9JHS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc15Q9JHS9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc15Q9JHS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc15Q9JHS9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc15Q9JHS9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cwc15Q9JHS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cwc15Q9JHS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cwc15Q9JHS9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cwc15Q9JHS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cwc15Q9JHS9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cwc15Q9JHS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cwc15Q9JHS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cwc15Q9JHS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cwc15Q9JHS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cwc15Q9JHS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cwc15Q9JHS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms