Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClpxQ9JHS4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClpxQ9JHS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClpxQ9JHS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClpxQ9JHS4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClpxQ9JHS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClpxQ9JHS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClpxQ9JHS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClpxQ9JHS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClpxQ9JHS4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClpxQ9JHS4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClpxQ9JHS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpxQ9JHS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms