Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4aQ9ET37 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4aQ9ET37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc5a4aQ9ET37 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slc5a4aQ9ET37 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc5a4aQ9ET37 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4aQ9ET37 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4aQ9ET37 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4aQ9ET37 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Slc5a4aQ9ET37 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc5a4aQ9ET37 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc5a4aQ9ET37 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slc5a4aQ9ET37 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slc5a4aQ9ET37 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slc5a4aQ9ET37 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4aQ9ET37 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slc5a4aQ9ET37 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc5a4aQ9ET37 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc5a4aQ9ET37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc5a4aQ9ET37 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slc5a4aQ9ET37 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slc5a4aQ9ET37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc5a4aQ9ET37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc5a4aQ9ET37 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc5a4aQ9ET37 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc5a4aQ9ET37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc5a4aQ9ET37 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slc5a4aQ9ET37 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc5a4aQ9ET37 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc5a4aQ9ET37 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc5a4aQ9ET37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc5a4aQ9ET37 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc5a4aQ9ET37 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc5a4aQ9ET37 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slc5a4aQ9ET37 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc5a4aQ9ET37 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc5a4aQ9ET37 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc5a4aQ9ET37 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc5a4aQ9ET37 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc5a4aQ9ET37 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc5a4aQ9ET37 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc5a4aQ9ET37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc5a4aQ9ET37 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc5a4aQ9ET37 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc5a4aQ9ET37 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms