Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ParvbQ9ES46 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ParvbQ9ES46 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ParvbQ9ES46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ParvbQ9ES46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ParvbQ9ES46 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ParvbQ9ES46 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ParvbQ9ES46 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ParvbQ9ES46 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ParvbQ9ES46 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ParvbQ9ES46 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ParvbQ9ES46 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ParvbQ9ES46 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ParvbQ9ES46 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ParvbQ9ES46 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ParvbQ9ES46 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ParvbQ9ES46 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ParvbQ9ES46 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvbQ9ES46 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvbQ9ES46 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ParvbQ9ES46 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvbQ9ES46 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvbQ9ES46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvbQ9ES46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ParvbQ9ES46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ParvbQ9ES46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ParvbQ9ES46 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ParvbQ9ES46 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ParvbQ9ES46 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ParvbQ9ES46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ParvbQ9ES46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ParvbQ9ES46 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ParvbQ9ES46 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ParvbQ9ES46 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.7 ms