Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ0

Suv39h2, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H2, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h2Q9EQQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Suv39h2Q9EQQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Suv39h2Q9EQQ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Suv39h2Q9EQQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Suv39h2Q9EQQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Suv39h2Q9EQQ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Suv39h2Q9EQQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Suv39h2Q9EQQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Suv39h2Q9EQQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Suv39h2Q9EQQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Suv39h2Q9EQQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Suv39h2Q9EQQ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Suv39h2Q9EQQ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Suv39h2Q9EQQ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Suv39h2Q9EQQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Suv39h2Q9EQQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Suv39h2Q9EQQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Suv39h2Q9EQQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Suv39h2Q9EQQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Suv39h2Q9EQQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Suv39h2Q9EQQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms