Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r56Q9EPS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r56Q9EPS9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r56Q9EPS9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r56Q9EPS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r56Q9EPS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r56Q9EPS9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r56Q9EPS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r56Q9EPS9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r56Q9EPS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r56Q9EPS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r56Q9EPS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r56Q9EPS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r56Q9EPS9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r56Q9EPS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r56Q9EPS9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r56Q9EPS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms