Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3fQ9DCH4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Eif3fQ9DCH4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Eif3fQ9DCH4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Eif3fQ9DCH4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3fQ9DCH4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3fQ9DCH4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3fQ9DCH4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3fQ9DCH4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3fQ9DCH4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3fQ9DCH4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3fQ9DCH4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3fQ9DCH4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3fQ9DCH4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3fQ9DCH4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3fQ9DCH4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3fQ9DCH4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3fQ9DCH4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3fQ9DCH4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3fQ9DCH4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3fQ9DCH4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3fQ9DCH4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3fQ9DCH4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3fQ9DCH4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3fQ9DCH4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms