Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ftsj3Q9DBE9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ftsj3Q9DBE9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ftsj3Q9DBE9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ftsj3Q9DBE9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ftsj3Q9DBE9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ftsj3Q9DBE9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ftsj3Q9DBE9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ftsj3Q9DBE9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ftsj3Q9DBE9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ftsj3Q9DBE9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ftsj3Q9DBE9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ftsj3Q9DBE9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ftsj3Q9DBE9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ftsj3Q9DBE9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ftsj3Q9DBE9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ftsj3Q9DBE9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ftsj3Q9DBE9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ftsj3Q9DBE9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ftsj3Q9DBE9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ftsj3Q9DBE9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ftsj3Q9DBE9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ftsj3Q9DBE9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ftsj3Q9DBE9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ftsj3Q9DBE9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ftsj3Q9DBE9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ftsj3Q9DBE9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ftsj3Q9DBE9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ftsj3Q9DBE9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ftsj3Q9DBE9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ftsj3Q9DBE9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ftsj3Q9DBE9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ftsj3Q9DBE9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ftsj3Q9DBE9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ftsj3Q9DBE9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ftsj3Q9DBE9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ftsj3Q9DBE9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ftsj3Q9DBE9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ftsj3Q9DBE9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ftsj3Q9DBE9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ftsj3Q9DBE9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ftsj3Q9DBE9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ftsj3Q9DBE9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ftsj3Q9DBE9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ftsj3Q9DBE9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ftsj3Q9DBE9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ftsj3Q9DBE9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms