Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smg9Q9DB90 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smg9Q9DB90 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg9Q9DB90 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smg9Q9DB90 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Smg9Q9DB90 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smg9Q9DB90 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smg9Q9DB90 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg9Q9DB90 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smg9Q9DB90 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smg9Q9DB90 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg9Q9DB90 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg9Q9DB90 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg9Q9DB90 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg9Q9DB90 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg9Q9DB90 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg9Q9DB90 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg9Q9DB90 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg9Q9DB90 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smg9Q9DB90 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg9Q9DB90 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg9Q9DB90 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg9Q9DB90 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg9Q9DB90 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smg9Q9DB90 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smg9Q9DB90 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg9Q9DB90 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smg9Q9DB90 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg9Q9DB90 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smg9Q9DB90 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smg9Q9DB90 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smg9Q9DB90 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smg9Q9DB90 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smg9Q9DB90 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smg9Q9DB90 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg9Q9DB90 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smg9Q9DB90 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smg9Q9DB90 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smg9Q9DB90 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg9Q9DB90 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg9Q9DB90 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg9Q9DB90 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms