Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR5

1700001F09Rik, RIKEN cDNA 1700001F09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001F09RikQ9DAR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700001F09RikQ9DAR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700001F09RikQ9DAR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700001F09RikQ9DAR5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700001F09RikQ9DAR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
1700001F09RikQ9DAR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700001F09RikQ9DAR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700001F09RikQ9DAR5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700001F09RikQ9DAR5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700001F09RikQ9DAR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700001F09RikQ9DAR5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700001F09RikQ9DAR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700001F09RikQ9DAR5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700001F09RikQ9DAR5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700001F09RikQ9DAR5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700001F09RikQ9DAR5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700001F09RikQ9DAR5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700001F09RikQ9DAR5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700001F09RikQ9DAR5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
1700001F09RikQ9DAR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700001F09RikQ9DAR5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700001F09RikQ9DAR5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700001F09RikQ9DAR5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700001F09RikQ9DAR5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700001F09RikQ9DAR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700001F09RikQ9DAR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700001F09RikQ9DAR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1700001F09RikQ9DAR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700001F09RikQ9DAR5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700001F09RikQ9DAR5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms