Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmtm2aQ9DAR1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cmtm2aQ9DAR1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtm2aQ9DAR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtm2aQ9DAR1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm2aQ9DAR1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm2aQ9DAR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm2aQ9DAR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm2aQ9DAR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm2aQ9DAR1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm2aQ9DAR1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm2aQ9DAR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm2aQ9DAR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm2aQ9DAR1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm2aQ9DAR1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmtm2aQ9DAR1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms