Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1mQ9DAD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1mQ9DAD9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2al1mQ9DAD9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1mQ9DAD9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al1mQ9DAD9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2al1mQ9DAD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2al1mQ9DAD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1mQ9DAD9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1mQ9DAD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1mQ9DAD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms