Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAA3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DAA3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DAA3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DAA3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9DAA3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9DAA3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DAA3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DAA3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DAA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DAA3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DAA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DAA3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DAA3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DAA3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DAA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DAA3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DAA3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DAA3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9DAA3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9DAA3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DAA3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms