Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmco5aQ9D9D5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmco5aQ9D9D5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tmco5aQ9D9D5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmco5aQ9D9D5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmco5aQ9D9D5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmco5aQ9D9D5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmco5aQ9D9D5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmco5aQ9D9D5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmco5aQ9D9D5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmco5aQ9D9D5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmco5aQ9D9D5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmco5aQ9D9D5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmco5aQ9D9D5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmco5aQ9D9D5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmco5aQ9D9D5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmco5aQ9D9D5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmco5aQ9D9D5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmco5aQ9D9D5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmco5aQ9D9D5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmco5aQ9D9D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmco5aQ9D9D5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco5aQ9D9D5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmco5aQ9D9D5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms