Protein–RNA interactions for Protein: Q9D875

2010109A12Rik, MCG1041431, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109A12RikQ9D875 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
2010109A12RikQ9D875 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
2010109A12RikQ9D875 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
2010109A12RikQ9D875 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
2010109A12RikQ9D875 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
2010109A12RikQ9D875 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
2010109A12RikQ9D875 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
2010109A12RikQ9D875 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
2010109A12RikQ9D875 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
2010109A12RikQ9D875 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
2010109A12RikQ9D875 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
2010109A12RikQ9D875 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
2010109A12RikQ9D875 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
2010109A12RikQ9D875 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
2010109A12RikQ9D875 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
2010109A12RikQ9D875 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
2010109A12RikQ9D875 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
2010109A12RikQ9D875 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
2010109A12RikQ9D875 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2010109A12RikQ9D875 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
2010109A12RikQ9D875 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
2010109A12RikQ9D875 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
2010109A12RikQ9D875 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
2010109A12RikQ9D875 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
2010109A12RikQ9D875 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
2010109A12RikQ9D875 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
2010109A12RikQ9D875 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
2010109A12RikQ9D875 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
2010109A12RikQ9D875 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
2010109A12RikQ9D875 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
2010109A12RikQ9D875 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
2010109A12RikQ9D875 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
2010109A12RikQ9D875 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
2010109A12RikQ9D875 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
2010109A12RikQ9D875 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
2010109A12RikQ9D875 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms