Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AplfQ9D842 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AplfQ9D842 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AplfQ9D842 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AplfQ9D842 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AplfQ9D842 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AplfQ9D842 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AplfQ9D842 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AplfQ9D842 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AplfQ9D842 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AplfQ9D842 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AplfQ9D842 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AplfQ9D842 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AplfQ9D842 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AplfQ9D842 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AplfQ9D842 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AplfQ9D842 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AplfQ9D842 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AplfQ9D842 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AplfQ9D842 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AplfQ9D842 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AplfQ9D842 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AplfQ9D842 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AplfQ9D842 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AplfQ9D842 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms