Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn23Q9D7D7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn23Q9D7D7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn23Q9D7D7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn23Q9D7D7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn23Q9D7D7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn23Q9D7D7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn23Q9D7D7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn23Q9D7D7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn23Q9D7D7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn23Q9D7D7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn23Q9D7D7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn23Q9D7D7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn23Q9D7D7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn23Q9D7D7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn23Q9D7D7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn23Q9D7D7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn23Q9D7D7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn23Q9D7D7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn23Q9D7D7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn23Q9D7D7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn23Q9D7D7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn23Q9D7D7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn23Q9D7D7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn23Q9D7D7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn23Q9D7D7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn23Q9D7D7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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