Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfn4Q9D6I3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pfn4Q9D6I3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pfn4Q9D6I3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pfn4Q9D6I3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pfn4Q9D6I3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pfn4Q9D6I3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pfn4Q9D6I3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pfn4Q9D6I3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfn4Q9D6I3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pfn4Q9D6I3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pfn4Q9D6I3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pfn4Q9D6I3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfn4Q9D6I3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfn4Q9D6I3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfn4Q9D6I3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfn4Q9D6I3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfn4Q9D6I3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfn4Q9D6I3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfn4Q9D6I3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfn4Q9D6I3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfn4Q9D6I3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pfn4Q9D6I3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pfn4Q9D6I3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pfn4Q9D6I3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pfn4Q9D6I3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfn4Q9D6I3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pfn4Q9D6I3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms