Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PudpQ9D5U5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PudpQ9D5U5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PudpQ9D5U5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PudpQ9D5U5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PudpQ9D5U5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PudpQ9D5U5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PudpQ9D5U5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PudpQ9D5U5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PudpQ9D5U5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PudpQ9D5U5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PudpQ9D5U5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PudpQ9D5U5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PudpQ9D5U5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PudpQ9D5U5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PudpQ9D5U5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PudpQ9D5U5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PudpQ9D5U5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PudpQ9D5U5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PudpQ9D5U5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PudpQ9D5U5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PudpQ9D5U5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PudpQ9D5U5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PudpQ9D5U5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PudpQ9D5U5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PudpQ9D5U5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PudpQ9D5U5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms