Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmntd1Q9D4C1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmntd1Q9D4C1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmntd1Q9D4C1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmntd1Q9D4C1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmntd1Q9D4C1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmntd1Q9D4C1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmntd1Q9D4C1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmntd1Q9D4C1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmntd1Q9D4C1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmntd1Q9D4C1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lmntd1Q9D4C1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmntd1Q9D4C1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmntd1Q9D4C1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmntd1Q9D4C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmntd1Q9D4C1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmntd1Q9D4C1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmntd1Q9D4C1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmntd1Q9D4C1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmntd1Q9D4C1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmntd1Q9D4C1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmntd1Q9D4C1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmntd1Q9D4C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmntd1Q9D4C1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmntd1Q9D4C1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmntd1Q9D4C1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.6 ms