Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap53Q9D439 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap53Q9D439 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap53Q9D439 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap53Q9D439 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap53Q9D439 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap53Q9D439 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap53Q9D439 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap53Q9D439 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap53Q9D439 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap53Q9D439 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap53Q9D439 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap53Q9D439 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap53Q9D439 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap53Q9D439 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap53Q9D439 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap53Q9D439 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap53Q9D439 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap53Q9D439 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap53Q9D439 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap53Q9D439 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap53Q9D439 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap53Q9D439 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cfap53Q9D439 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cfap53Q9D439 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap53Q9D439 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap53Q9D439 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfap53Q9D439 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cfap53Q9D439 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfap53Q9D439 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfap53Q9D439 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfap53Q9D439 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cfap53Q9D439 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cfap53Q9D439 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cfap53Q9D439 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cfap53Q9D439 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfap53Q9D439 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cfap53Q9D439 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cfap53Q9D439 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cfap53Q9D439 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cfap53Q9D439 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cfap53Q9D439 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms