Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pramef12Q9D2F1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pramef12Q9D2F1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pramef12Q9D2F1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pramef12Q9D2F1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pramef12Q9D2F1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pramef12Q9D2F1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pramef12Q9D2F1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pramef12Q9D2F1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pramef12Q9D2F1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pramef12Q9D2F1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pramef12Q9D2F1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pramef12Q9D2F1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pramef12Q9D2F1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pramef12Q9D2F1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pramef12Q9D2F1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pramef12Q9D2F1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pramef12Q9D2F1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pramef12Q9D2F1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pramef12Q9D2F1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pramef12Q9D2F1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pramef12Q9D2F1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pramef12Q9D2F1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pramef12Q9D2F1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pramef12Q9D2F1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pramef12Q9D2F1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pramef12Q9D2F1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pramef12Q9D2F1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Pramef12Q9D2F1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pramef12Q9D2F1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pramef12Q9D2F1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pramef12Q9D2F1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pramef12Q9D2F1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pramef12Q9D2F1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pramef12Q9D2F1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pramef12Q9D2F1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pramef12Q9D2F1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pramef12Q9D2F1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pramef12Q9D2F1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms