Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Batf3Q9D275 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Batf3Q9D275 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Batf3Q9D275 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Batf3Q9D275 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Batf3Q9D275 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Batf3Q9D275 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Batf3Q9D275 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Batf3Q9D275 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Batf3Q9D275 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Batf3Q9D275 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Batf3Q9D275 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Batf3Q9D275 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Batf3Q9D275 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Batf3Q9D275 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Batf3Q9D275 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Batf3Q9D275 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Batf3Q9D275 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Batf3Q9D275 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Batf3Q9D275 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Batf3Q9D275 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Batf3Q9D275 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms