Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Krtap5-3Q9D226 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Krtap5-3Q9D226 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Krtap5-3Q9D226 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Krtap5-3Q9D226 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Krtap5-3Q9D226 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Krtap5-3Q9D226 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Krtap5-3Q9D226 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Krtap5-3Q9D226 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Krtap5-3Q9D226 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Krtap5-3Q9D226 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Krtap5-3Q9D226 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Krtap5-3Q9D226 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Krtap5-3Q9D226 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krtap5-3Q9D226 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krtap5-3Q9D226 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krtap5-3Q9D226 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krtap5-3Q9D226 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Krtap5-3Q9D226 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krtap5-3Q9D226 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Krtap5-3Q9D226 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Krtap5-3Q9D226 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krtap5-3Q9D226 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Krtap5-3Q9D226 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Krtap5-3Q9D226 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krtap5-3Q9D226 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Krtap5-3Q9D226 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Krtap5-3Q9D226 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Krtap5-3Q9D226 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Krtap5-3Q9D226 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krtap5-3Q9D226 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Krtap5-3Q9D226 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms