Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MrnipQ9D1F5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MrnipQ9D1F5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MrnipQ9D1F5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MrnipQ9D1F5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MrnipQ9D1F5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MrnipQ9D1F5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MrnipQ9D1F5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MrnipQ9D1F5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MrnipQ9D1F5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MrnipQ9D1F5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MrnipQ9D1F5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MrnipQ9D1F5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MrnipQ9D1F5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MrnipQ9D1F5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MrnipQ9D1F5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MrnipQ9D1F5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MrnipQ9D1F5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MrnipQ9D1F5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MrnipQ9D1F5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MrnipQ9D1F5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MrnipQ9D1F5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MrnipQ9D1F5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MrnipQ9D1F5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MrnipQ9D1F5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MrnipQ9D1F5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms