Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snu13Q9D0T1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snu13Q9D0T1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snu13Q9D0T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snu13Q9D0T1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snu13Q9D0T1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snu13Q9D0T1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snu13Q9D0T1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snu13Q9D0T1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snu13Q9D0T1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snu13Q9D0T1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snu13Q9D0T1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snu13Q9D0T1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snu13Q9D0T1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snu13Q9D0T1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snu13Q9D0T1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snu13Q9D0T1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms