Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2v1Q9CZY3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2v1Q9CZY3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2v1Q9CZY3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2v1Q9CZY3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2v1Q9CZY3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2v1Q9CZY3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2v1Q9CZY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2v1Q9CZY3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2v1Q9CZY3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2v1Q9CZY3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2v1Q9CZY3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2v1Q9CZY3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2v1Q9CZY3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2v1Q9CZY3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms