Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmem39aQ9CYC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmem39aQ9CYC3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmem39aQ9CYC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tmem39aQ9CYC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmem39aQ9CYC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tmem39aQ9CYC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Tmem39aQ9CYC3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmem39aQ9CYC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmem39aQ9CYC3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmem39aQ9CYC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmem39aQ9CYC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tmem39aQ9CYC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tmem39aQ9CYC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmem39aQ9CYC3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmem39aQ9CYC3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmem39aQ9CYC3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmem39aQ9CYC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmem39aQ9CYC3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmem39aQ9CYC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmem39aQ9CYC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmem39aQ9CYC3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmem39aQ9CYC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmem39aQ9CYC3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmem39aQ9CYC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmem39aQ9CYC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmem39aQ9CYC3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmem39aQ9CYC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmem39aQ9CYC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmem39aQ9CYC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmem39aQ9CYC3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmem39aQ9CYC3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmem39aQ9CYC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmem39aQ9CYC3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms