Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ssr1Q9CY50 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ssr1Q9CY50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ssr1Q9CY50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ssr1Q9CY50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ssr1Q9CY50 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ssr1Q9CY50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssr1Q9CY50 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ssr1Q9CY50 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssr1Q9CY50 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssr1Q9CY50 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssr1Q9CY50 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssr1Q9CY50 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ssr1Q9CY50 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssr1Q9CY50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssr1Q9CY50 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssr1Q9CY50 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssr1Q9CY50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssr1Q9CY50 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssr1Q9CY50 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssr1Q9CY50 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssr1Q9CY50 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssr1Q9CY50 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ssr1Q9CY50 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ssr1Q9CY50 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms