Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc17Q9CXD9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc17Q9CXD9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc17Q9CXD9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc17Q9CXD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc17Q9CXD9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc17Q9CXD9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrc17Q9CXD9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc17Q9CXD9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc17Q9CXD9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc17Q9CXD9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc17Q9CXD9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc17Q9CXD9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc17Q9CXD9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc17Q9CXD9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc17Q9CXD9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc17Q9CXD9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc17Q9CXD9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc17Q9CXD9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrc17Q9CXD9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lrrc17Q9CXD9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrrc17Q9CXD9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lrrc17Q9CXD9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc17Q9CXD9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc17Q9CXD9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc17Q9CXD9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc17Q9CXD9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc17Q9CXD9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc17Q9CXD9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc17Q9CXD9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc17Q9CXD9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc17Q9CXD9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc17Q9CXD9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc17Q9CXD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lrrc17Q9CXD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc17Q9CXD9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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