Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdca4Q9CWM2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdca4Q9CWM2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdca4Q9CWM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdca4Q9CWM2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdca4Q9CWM2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdca4Q9CWM2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdca4Q9CWM2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdca4Q9CWM2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdca4Q9CWM2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdca4Q9CWM2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdca4Q9CWM2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdca4Q9CWM2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca4Q9CWM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca4Q9CWM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca4Q9CWM2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdca4Q9CWM2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdca4Q9CWM2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdca4Q9CWM2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca4Q9CWM2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdca4Q9CWM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca4Q9CWM2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdca4Q9CWM2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdca4Q9CWM2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdca4Q9CWM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdca4Q9CWM2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca4Q9CWM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca4Q9CWM2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca4Q9CWM2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca4Q9CWM2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca4Q9CWM2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdca4Q9CWM2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca4Q9CWM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca4Q9CWM2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca4Q9CWM2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca4Q9CWM2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdca4Q9CWM2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdca4Q9CWM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms