Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVN6

Cby3, Protein chibby homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cby3Q9CVN6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cby3Q9CVN6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cby3Q9CVN6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cby3Q9CVN6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cby3Q9CVN6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cby3Q9CVN6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cby3Q9CVN6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cby3Q9CVN6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cby3Q9CVN6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cby3Q9CVN6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cby3Q9CVN6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cby3Q9CVN6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cby3Q9CVN6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cby3Q9CVN6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cby3Q9CVN6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cby3Q9CVN6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cby3Q9CVN6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cby3Q9CVN6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cby3Q9CVN6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cby3Q9CVN6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cby3Q9CVN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cby3Q9CVN6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cby3Q9CVN6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cby3Q9CVN6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cby3Q9CVN6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cby3Q9CVN6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cby3Q9CVN6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cby3Q9CVN6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cby3Q9CVN6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cby3Q9CVN6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cby3Q9CVN6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cby3Q9CVN6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cby3Q9CVN6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cby3Q9CVN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms