Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sft2d3Q9CSV6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sft2d3Q9CSV6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sft2d3Q9CSV6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sft2d3Q9CSV6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sft2d3Q9CSV6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sft2d3Q9CSV6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sft2d3Q9CSV6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sft2d3Q9CSV6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sft2d3Q9CSV6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sft2d3Q9CSV6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d3Q9CSV6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sft2d3Q9CSV6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sft2d3Q9CSV6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sft2d3Q9CSV6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sft2d3Q9CSV6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sft2d3Q9CSV6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms