Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EcdQ9CS74 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EcdQ9CS74 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EcdQ9CS74 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EcdQ9CS74 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EcdQ9CS74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EcdQ9CS74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EcdQ9CS74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EcdQ9CS74 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EcdQ9CS74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EcdQ9CS74 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EcdQ9CS74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EcdQ9CS74 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EcdQ9CS74 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EcdQ9CS74 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EcdQ9CS74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EcdQ9CS74 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EcdQ9CS74 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EcdQ9CS74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EcdQ9CS74 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EcdQ9CS74 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EcdQ9CS74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EcdQ9CS74 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms