Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdpd1Q9CRY7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd1Q9CRY7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd1Q9CRY7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd1Q9CRY7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd1Q9CRY7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd1Q9CRY7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd1Q9CRY7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd1Q9CRY7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpd1Q9CRY7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpd1Q9CRY7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gdpd1Q9CRY7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd1Q9CRY7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd1Q9CRY7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd1Q9CRY7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd1Q9CRY7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd1Q9CRY7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd1Q9CRY7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdpd1Q9CRY7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gdpd1Q9CRY7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdpd1Q9CRY7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd1Q9CRY7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpd1Q9CRY7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd1Q9CRY7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdpd1Q9CRY7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd1Q9CRY7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd1Q9CRY7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd1Q9CRY7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd1Q9CRY7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd1Q9CRY7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd1Q9CRY7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms