Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc43Q9CR29 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc43Q9CR29 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc43Q9CR29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc43Q9CR29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc43Q9CR29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc43Q9CR29 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc43Q9CR29 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc43Q9CR29 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc43Q9CR29 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc43Q9CR29 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc43Q9CR29 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc43Q9CR29 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc43Q9CR29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc43Q9CR29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc43Q9CR29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc43Q9CR29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc43Q9CR29 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc43Q9CR29 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc43Q9CR29 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc43Q9CR29 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc43Q9CR29 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc43Q9CR29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc43Q9CR29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc43Q9CR29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc43Q9CR29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc43Q9CR29 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc43Q9CR29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc43Q9CR29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc43Q9CR29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc43Q9CR29 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc43Q9CR29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc43Q9CR29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc43Q9CR29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc43Q9CR29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc43Q9CR29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc43Q9CR29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc43Q9CR29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc43Q9CR29 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms