Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nicn1Q9CQM0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nicn1Q9CQM0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nicn1Q9CQM0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nicn1Q9CQM0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nicn1Q9CQM0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nicn1Q9CQM0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nicn1Q9CQM0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nicn1Q9CQM0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nicn1Q9CQM0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nicn1Q9CQM0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nicn1Q9CQM0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nicn1Q9CQM0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nicn1Q9CQM0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nicn1Q9CQM0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nicn1Q9CQM0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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